用电渗析脱盐设备制取淡水，应根据原水浓度、淡水产量和脱盐指标来选择运行方式，以期受到良好的效果。一般电渗析脱盐工艺分为连续式和循环式两种。
　　一、连续式
　　（1）1级一段（或多段）一次脱盐：1级一段是指原水经过膜堆内部的并联隔板之后，直接流出淡水。而1级多段则是水流经过膜堆内部串联各段之后流出淡水。因为从电渗析器流出的水，便是制得的淡水，故称为一次脱盐。
　　（2）多级多段一次脱盐：多级多段一次脱盐，指原水依次通过多台1级一段的电渗析器，同时进行串联脱盐。也指设有共电极的一台电渗析器，进行多级多段串联。关于串联级数，应根据原水浓度、淡水指标以及电渗析器的工作性能而定。每级脱盐率为25—60%，串联级数一般为2—6级。该形式的特点是：可以连续制水，不需要进行淡水循环即能达到要求的脱盐率，适用于大型制水部门，工矿企业采用较多。
　　二、循环式
　　（1）分批循环脱盐：是指浓水和淡水分别通过各自的循环槽进行循环，一直达到要求的淡水指标为止，然后再开始另一批处理。
　　（2）连续部分循环脱盐：它是一种以部分循环脱盐，同时连续生产淡水的新形式。在这种系统中，淡水和浓水分别进行循环。当达到淡水的出水指标后，启开淡水排放阀门，便连续送出淡水，同时补充加入等量原水到循环水槽中去。这种使淡水进行部分循环的方式，可以满足广泛的脱盐范围要求。